Défenseur originaire de Duluth, dans l’État du Minnesota, Sean Hill a été sélectionné en 8e ronde par les Canadiens, le 167e choix au total, lors du repêchage de 1988. Il a fait ses débuts avec le Tricolore au printemps 1991, disputant le premier match de la série contre les Bruins de Boston en finale de la division Adams. Le scénario s’est répété la saison suivante où les quatre parties qu’il a disputées avec les Canadiens furent lors de la série contre les Bruins au printemps 1992, lui qui avait pris part aux Jeux olympiques d’Albertville.  Il a finalement fait sa niche à Montréal la saison suivante, disputant 31 parties en saison régulière et trois en séries, aidant la formation montréalaise dans sa 24e conquête de la coupe Stanley.

Au cours de sa carrière de 17 saisons dans la LNH, Sean Hill a aussi évolué avec les Sénateurs d’Ottawa, les Hurricanes de la Caroline, les Blues de Saint-Louis, les Panthers de la Floride, les Islanders de New York et le Wild du Minnesota.